「アイドリングストップでクルマに悪影響はあるのか？」

お答えします。おっしゃるとおり、クルマが停止しているときにエンジンをストップさせることによって燃費は良くなるでしょう。

通常、アイドリング時にはスロットルバルブが閉じた状態になるため、アクセルを軽くあけた状態（走行時）に比べ、ピストン運動がしにくくなります。このエンジンの機械的な損失（ポンピング・ロス）が大きいと、燃費の悪化につながります。
さらにアイドリング状態では、燃料の濃さを理想的な燃焼時より薄い状態にすることができないため、これもまた燃費を悪くしているのです。

さて、アイドリングストップを行ったときの悪影響ですが、イグニッションのスイッチとキーの劣化が通常より早まるのは致し方ないでしょうね。クルマのなかで一番電気の消費が大きいスターターモーター関係も同様です。
また、必要以上にスターターを回せば、バッテリーや発電機に負担がかかります。

このような部品の負担なども考えると、過度なアイドリングストップはあまり効果的とは思えません。
普段走っている道であれば、時間のかかる踏切や信号待ちを把握していることと思いますので、長いアイドリング状態だと思うところで要所要所アイドリングストップするのはいかがでしょうか。クルマにも環境にも優しくできると思います。